Директор: Т. Багашка
Отдел 1 " Централни органи и държавни висши училища";
Отдел 2 "Централни органи и държавни висши училища";
Отдел 3 - "Местни органи".
Одитна дирекция I "Одити за съответствие при финансовото управление"
Директор: Р. Данова
Отдел 1 " Централни органи";
Отдел 2 "Централни органи";
Отдел 3 - "Местни органи".
Одитна дирекция "Одити на изпълнението"
Директор: Росена Гаджева
Отдел 1 "Одит на изпълнението";
Отдел 2 "Одит на изпълнението на средства от Европейския съюз".
Одитна дирекция II "Финансови одити"
Директор: Ю. Качкова
Отдел 1 " Централни органи";
Отдел 2 "Местни органи";
Отдел 3 - "Местни органи".
Одитна дирекция II "Одити за съответствие при финансовото управление"
Директор: П. Михайлова
Отдел 1 " Централни органи";
Отдел 2 "Централни органи";
Отдел 3 - "Местни органи".
Одитна дирекция "Специфични одити"
Директор: Е. Перчева
Отдел 1 "Политически партии";
Отдел 2 "Други специфични одити".